Ce que nous savons de la variante Covid-19 en Inde

Les experts en santé publique affirment que la vague d’infections semble être motivée par bon nombre des mêmes raisons qui ont fait grimper le nombre de cas ailleurs – principalement un assouplissement des mesures de contrôle de la pandémie – mais il y a de fortes indications que les variables sont également un facteur.

Bien que l’on ne sache pas encore grand-chose sur la variante, les scientifiques disent que les premières données indiquent que le double mutant, qui a été détecté pour la première fois en Inde dans un échantillon collecté en octobre, est plus contagieux que la version originale du virus et s’est propagé rapidement à travers certaines parties. du pays, y compris le Maharashtra, qui abrite la capitale financière Mumbai.

Les experts en santé publique se sont déclarés surpris par l’escalade massive de cette vague, qui déchire la population à un rythme plus rapide que certaines augmentations précédentes dans d’autres pays.

À la mi-février, le nombre de cas quotidiens en Inde est tombé en dessous de 10 000 et le nombre de décès est tombé à deux chiffres. Avance rapide pendant deux mois, et les cas sont passés à plus de 200 000 pendant huit jours consécutifs, atteignant un record quotidien pour un pays de plus de 332 000 vendredi. Le nombre de morts est passé à 2 263, portant le total à 186 920.

«Les gens ont été pris au dépourvu», a déclaré le Dr Lalit Kant, épidémiologiste des maladies infectieuses et ancien chef du département d’épidémiologie et des maladies infectieuses au Conseil indien de la recherche médicale. « Nous ne nous attendions pas à ce qu’un grand nombre de personnes soient infectées, ainsi que le nombre de personnes qui auraient besoin de soins de santé. »

Nouvelles variantes de virus Il était derrière les augmentations précédentes ailleurs, par exemple au Royaume-Uni à la fin de l’année dernière. Mais le taux récent d’augmentation des cas en Inde a été beaucoup plus rapide que dans la vague précédente du pays, et plus rapide que les augmentations plus graduelles largement observées ailleurs. Aux États-Unis, par exemple, la dernière grande vague s’est accumulée sur une période de trois mois, à partir de septembre, et a culminé à 295 215 cas quotidiens le 8 janvier.

Les scientifiques affirment que l’Inde était prête pour une autre vague, car de nombreuses personnes ont abandonné les masques et d’autres mesures de sécurité, et le gouvernement a autorisé des rassemblements politiques massifs et des festivals religieux, qui pourraient avoir été des événements miraculeux.

«L’Inde a eu un double coup dur», a déclaré T. Jacob John, professeur retraité de virologie au Christian Medical College de Vellore, dans le sud de l’Inde. « Nous avons baissé la garde lorsque les variables se propageaient. C’était le pire moment pour le faire. »

Les variantes sont réparties dans la population Peut-être a-t-il ajouté de l’huile sur le feu. La double mutation, la variante britannique la plus contagieuse, ainsi que les variantes brésilienne et sud-africaine, ont été détectées en Inde, selon le ministère de la Santé. Vendredi, à New Delhi, la mère porteuse britannique était responsable de la moitié des cas au cours de la dernière semaine de mars, a déclaré Sujit Singh, directeur du National Center for Disease Control, qui fait partie du ministère indien de la Santé.

La variante indienne contient 13 mutations, mais elle tire son nom de deux mutations similaires à celles qui apparaissent séparément dans les autres variantes. Dans d’autres variantes, une mutation est associée à rendre le virus plus infectieux et semble mieux éviter les anticorps, tandis que l’autre est similaire à celle qui a montré des signes de sa capacité à échapper à certaines des réponses immunitaires du corps.

Le Dr Rakesh Mishra, directeur du CSIR Center for Cellular and Molecular Biology, qui dirige l’un des 10 laboratoires d’État chargés du séquençage génétique du virus, a déclaré qu’il avait été détecté pour la première fois en Inde dans un échantillon collecté en octobre. Des données récentes indiquent sa propagation rapide dans certaines régions de l’Inde.

Dans l’état durement touché du Maharashtra, le double mutant est devenu la race prédominante, selon le Dr Anurag Agrawal, directeur du CSIR Institute of Genomics and Integrative Biology. Dans les échantillons collectés dans l’État de janvier à mars, plus de 60% du variant était double mutant, selon une étude de l’Institut national de virologie de Pune.

Pour l’ensemble du pays, cette variable représentait 70,4% des échantillons prélevés au cours de la semaine se terminant le 25 mars, contre 16,1% il y a à peine trois semaines, selon Covid CG, un outil de suivi du Broad Institute of MIT et de Harvard. L’outil utilise les données de l’Initiative GISAID, qui est une base de données mondiale des génomes de coronavirus.

«Une fois qu’il devient une variante dominante à un endroit, cela devient inquiétant car cela signifie qu’il pourrait bientôt devenir la variante dominante ailleurs», a déclaré Alina Chan, une chercheuse postdoctorale spécialisée dans la thérapie génique et l’ingénierie cellulaire au Broad Institute du MIT et à Harvard. ».

Des scientifiques en Inde, aux États-Unis et dans d’autres pays étudient la variante en laboratoire pour voir comment le virus réagit aux anticorps. Mais même sans savoir comment la variante interagit avec les vaccins ou la réponse immunitaire du corps, les scientifiques affirment que la double mutation a le potentiel de provoquer d’autres infections dans le monde.

Le virus s’est déjà propagé dans au moins 21 pays, selon des chercheurs de quatre universités qui suivent les souches virales. Le séquençage génétique a révélé des cas aux États-Unis, en Allemagne, en Turquie et au Nigéria, entre autres pays. Au Royaume-Uni, la séquence du génome muté a été trouvée chez des personnes n’ayant pas voyagé, indiquant qu’elle s’était propagée au sein de la communauté.

En Australie, la double mutation représentait 40% des échantillons prélevés au cours de la semaine se terminant le 15 avril, contre 16,7% le mois précédent, selon Covid CG. 66,7% des échantillons de Nouvelle-Zélande représentaient la semaine se terminant le 8 avril, contre 20% un mois plus tôt.

En Californie, au moins 20 cas confirmés ou présumés de la double mutation ont été découverts depuis fin mars, selon le Dr Benjamin Pinsky, directeur du laboratoire de virologie clinique de l’Université de Stanford. Le Dr Pinsky a déclaré que des échantillons avaient déjà été envoyés à des collaborateurs d’autres laboratoires, où des recherches sont en cours pour tester comment le virus interagit avec les anticorps monoclonaux et le plasma de personnes infectées ou vaccinées.

Le Dr Pinsky a déclaré que cette recherche pourrait aider à développer un vaccin à l’avenir, en particulier des injections de rappel qui ciblent différents types de Covid-19.

Les médecins et les experts en santé publique ont déclaré que de nombreux jeunes tombent maintenant malades et se rendent à l’hôpital avec des symptômes graves. Dans cette augmentation, a déclaré le Dr Kant, les personnes âgées de 26 à 44 ans représentent environ 40% de tous les cas et 10% des décès, par rapport à la vague précédente, où presque tous les décès concernaient des personnes de 60 ans et plus.

Écrire à Shan Lee à [email protected] et Vibhuti Agarwal à [email protected]